More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2850 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 
141 aa  286  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  84.4 
 
 
142 aa  243  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  80.14 
 
 
141 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  80.14 
 
 
141 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  79.43 
 
 
143 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  79.43 
 
 
141 aa  229  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  80.14 
 
 
143 aa  229  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  78.72 
 
 
141 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  76.6 
 
 
143 aa  228  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
141 aa  228  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 
143 aa  227  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 
143 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  79.43 
 
 
143 aa  227  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 
143 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 
141 aa  226  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 
141 aa  226  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  78.72 
 
 
143 aa  226  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
141 aa  226  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 
143 aa  226  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  77.3 
 
 
143 aa  224  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  76.6 
 
 
143 aa  221  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
143 aa  221  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
141 aa  221  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
143 aa  220  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  75.18 
 
 
164 aa  220  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  76.81 
 
 
139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
143 aa  218  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  218  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  218  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  218  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
143 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  75.89 
 
 
143 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  76.64 
 
 
144 aa  217  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  78.52 
 
 
135 aa  217  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  75.89 
 
 
141 aa  217  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  75.89 
 
 
142 aa  216  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  216  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  216  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
141 aa  214  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  215  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
143 aa  214  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
143 aa  214  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  214  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  213  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  213  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
141 aa  213  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  213  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
143 aa  213  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
143 aa  211  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2612  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
141 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00143318  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2193  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1110  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1348  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1838  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2358  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0059  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.147771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2231  nucleoside diphosphate kinase  73.76 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2231  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  74.47 
 
 
141 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1868  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  72.86 
 
 
142 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3394  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 
141 aa  208  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  71.63 
 
 
143 aa  208  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 
141 aa  208  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  207  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 
159 aa  207  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 
142 aa  207  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2989  nucleoside diphosphate kinase  75.19 
 
 
142 aa  206  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0674599  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 
141 aa  206  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0662  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 
141 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  205  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  206  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 
141 aa  206  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
141 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  205  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0084  nucleoside-diphosphate kinase  71.63 
 
 
141 aa  205  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.311434  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 
142 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  72.79 
 
 
137 aa  204  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 
141 aa  204  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1293  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 
141 aa  204  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000414366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1423  nucleoside diphosphate kinase  72.34 
 
 
141 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235945  normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  71.63 
 
 
142 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  70.21 
 
 
141 aa  204  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  68.35 
 
 
140 aa  203  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  74.07 
 
 
137 aa  203  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  71.32 
 
 
137 aa  203  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  70.92 
 
 
141 aa  203  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  70.21 
 
 
142 aa  202  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1147  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.662914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  69.5 
 
 
143 aa  201  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1055  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 
141 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>