More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1417 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1417  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5552  transcriptional regulator, LysR family  49.01 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4233  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0392  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.06 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.06 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.97 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  25.73 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.47 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.42 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.42 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.42 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.42 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.07 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2742  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.42 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0588637  normal  0.665335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0553  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141642  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2817  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.4 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  26.91 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  35.86 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.19 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.19 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.19 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0443  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0449  transcriptional regulator, LysR family  21.52 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  25.84 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  27.24 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1001  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1784  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.77 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.87 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.28 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  35.67 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.82 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1200  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.78 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>