77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0454 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0454  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 		 320 aa  643    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06570  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.74 
 
 		 292 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0545  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.37 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3875  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.4 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.400709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1032  hypothetical protein  27.09 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11250  hypothetical protein  28.69 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0553  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0500  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0535  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4476  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.95 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0677  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  28.29 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5031  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.48 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1403  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.3 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211248 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0049  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.44 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.35 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3384  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.66 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0997  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase-like  26.42 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000450509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.66 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6651  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.66 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.89 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.89 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6249  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.95 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0145241  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2888  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.53 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.124362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.23 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  22.13 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.14 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  20.55 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  22.18 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3502  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.3 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3842  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.53 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3501  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.73 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2379  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.17 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.502871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.14 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4945  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.73 
 
 		 286 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.03 
 
 		 723 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1072  TDP-rhamnose synthetase, NAD(P)-binding  23.58 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3993  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.79 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.79 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.93 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0620  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.56 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3287  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.39 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.86 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.57 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.79 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03172  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.39 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3020  dTDP-6-deoxy-l-mannose-dehydrogenase  22.86 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1741  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.15 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.32 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  21.78 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3845  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.98 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0198  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.25 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2712  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.41 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3546  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.9 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2239  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.59 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.562974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0714  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.82 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.52 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405671 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.78 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.21 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.43 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2292  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.04 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0506  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.79 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076181  normal  0.0104693 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0227  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.87 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3490  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.49 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4057  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.08 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3345  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.36 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0900  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.16 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-32 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2120  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.06 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.43 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.17 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4724  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.24 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.004454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1396  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.74 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.1 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4021  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.32 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4165  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.71 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  0.0599581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>