More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6580 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 719 aa  1458    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  47.74 
 
 		 715 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  43.53 
 
 		 721 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 		 751 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  40.38 
 
 		 716 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 732 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  39.86 
 
 		 716 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  39.84 
 
 		 727 aa  502  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  40.37 
 
 		 708 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 688 aa  465  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  38.09 
 
 		 709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 		 686 aa  399  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 		 679 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 681 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  33.83 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 		 712 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 		 698 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 		 698 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 		 722 aa  253  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.4 
 
 		 699 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.31 
 
 		 699 aa  180  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 		 408 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.34 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.16 
 
 		 609 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.98 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.98 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.98 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.98 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.98 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.16 
 
 		 609 aa  107  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.42 
 
 		 386 aa  104  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.79 
 
 		 609 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 530 aa  101  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 		 715 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 		 715 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  28.53 
 
 		 614 aa  98.6  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 389 aa  98.2  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 389 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  27.09 
 
 		 387 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 614 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.12 
 
 		 385 aa  95.1  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 396 aa  94.7  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.51 
 
 		 387 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.98 
 
 		 608 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  23.21 
 
 		 747 aa  92  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 		 611 aa  91.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.22 
 
 		 387 aa  91.3  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.65 
 
 		 756 aa  91.3  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.22 
 
 		 387 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.22 
 
 		 387 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 609 aa  90.9  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.22 
 
 		 387 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.22 
 
 		 387 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.33 
 
 		 379 aa  90.5  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.22 
 
 		 387 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.22 
 
 		 387 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.22 
 
 		 387 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  23.13 
 
 		 723 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 		 399 aa  89.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 387 aa  88.2  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.56 
 
 		 375 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 		 392 aa  87  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.56 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.56 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.56 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.56 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.56 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  26.3 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  26.06 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.98 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  28.76 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  22.96 
 
 		 674 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  23.89 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.17 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  23.39 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  27.19 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.19 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  27.19 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 398 aa  76.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  25.53 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  21.2 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  22.09 
 
 		 764 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  25.47 
 
 		 683 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.68 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  23.94 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.28 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  21.86 
 
 		 816 aa  73.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00004515  normal  0.344688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>