271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6249 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 117 aa  240  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  44.57 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  41.28 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  38.95 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  37.36 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  36.96 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  36.79 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  42.17 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  38.55 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  43.01 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  36.59 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  35.92 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  40.28 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  35.9 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  38.55 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  36.05 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  35.23 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  40.85 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  30.17 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  30.43 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  36.71 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  34.95 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  43.48 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  30.39 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  31.91 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  36.62 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  39.47 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  39.47 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  44.78 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  31.11 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  31.13 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  33.77 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  38.57 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  32.56 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  43.42 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  37.78 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  38.57 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.94 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  42.03 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  34.29 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  32.22 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  36.67 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  36.67 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  32.58 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.95 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  30.53 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  34.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.29 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  33.67 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  37.31 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  36.67 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  38.03 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>