100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5729 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  66.67 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  59.35 
 
 		 215 aa  261  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  52.78 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  53.24 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  52.36 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  49.54 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  47.03 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  44.75 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  44.29 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  44.09 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  41.55 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  37.84 
 
 		 226 aa  147  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  30.91 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3938  hypothetical protein  32.02 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  26.55 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  29.22 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  32.26 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  26.22 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  29.48 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  25.27 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  26.74 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2168  hypothetical protein  26.89 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02805  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.541776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  26.64 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1639  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.87 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243348  normal  0.0401648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4984  hypothetical protein  27.43 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  30.07 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.64 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  24.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  24.77 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  23.85 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  26.17 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0415  hypothetical protein  27.72 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.23 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  26.49 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  26.49 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  26.49 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  26.49 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  26.49 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  26.49 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  26.49 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  25.46 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  25.46 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1666  putative oxidoreductase  23.9 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.103837  normal  0.0874109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  23.39 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1486  oxidoreductase  23.41 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.175659  normal  0.304876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0358  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  24.73 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  25.83 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  24.86 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.81 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.38 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25.27 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05841  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  26.35 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.38 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  24.73 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  24.73 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2265  hypothetical protein  25.41 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.908701  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  25.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2917  Male sterility-like  25.17 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.958914  normal  0.0966532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543153  normal  0.186326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1130  NADH dehydrogenase  23.7 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  25.9 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  27.1 
 
 		 301 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0732  hypothetical protein  23.83 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  26.83 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  25.9 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 328 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0624  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.33 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3833  hypothetical protein  23.24 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  24.29 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3209  hypothetical protein  22.12 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  0.165014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  21.2 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  24.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 329 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 330 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08290  hypothetical protein  26.11 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0590797  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41353  predicted protein  24.03 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  36.99 
 
 		 311 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  29.03 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3344  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.56 
 
 		 211 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 		 291 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 		 211 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.18 
 
 		 297 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 		 211 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 327 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  28 
 
 		 279 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>