30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3792 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3792  Carbohydrate-binding family V/XII  100 
 
 		 125 aa  260  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156874  normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  41.27 
 
 		 816 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  44.44 
 
 		 426 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  42.37 
 
 		 1057 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  47.06 
 
 		 675 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  41.38 
 
 		 1054 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  45.1 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  38.89 
 
 		 1053 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.59 
 
 		 486 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  42.59 
 
 		 848 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  36.9 
 
 		 443 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  35.71 
 
 		 540 aa  42  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  39.29 
 
 		 420 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  42.31 
 
 		 772 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  48.65 
 
 		 1362 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  48.21 
 
 		 353 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  51.35 
 
 		 451 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  51.35 
 
 		 451 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  46.15 
 
 		 451 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  41.67 
 
 		 353 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  43.4 
 
 		 1577 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  46.15 
 
 		 451 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.59 
 
 		 626 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 		 393 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  48.65 
 
 		 451 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  46.15 
 
 		 451 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 1242 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  41.03 
 
 		 868 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  41.03 
 
 		 868 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 445 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>