More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3732 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3732  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
393 aa  818    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  57.84 
 
 
390 aa  528  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  60.26 
 
 
391 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  57.33 
 
 
388 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  58.46 
 
 
402 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2612  Cystathionine gamma-synthase  59.17 
 
 
395 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.35 
 
 
392 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.64 
 
 
397 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.83 
 
 
404 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.83 
 
 
404 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.48 
 
 
389 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.34 
 
 
396 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.29 
 
 
403 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.85 
 
 
399 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.1 
 
 
393 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.8 
 
 
397 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.95 
 
 
395 aa  385  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.35 
 
 
394 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.66 
 
 
393 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  47.04 
 
 
396 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.96 
 
 
406 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.46 
 
 
403 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.21 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.72 
 
 
397 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.26 
 
 
402 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.51 
 
 
403 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.72 
 
 
403 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.98 
 
 
403 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.72 
 
 
403 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.62 
 
 
383 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.75 
 
 
402 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.19 
 
 
394 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.46 
 
 
403 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.85 
 
 
396 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.98 
 
 
403 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.27 
 
 
402 aa  365  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.71 
 
 
394 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.27 
 
 
407 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.61 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 
391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
397 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.09 
 
 
396 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  46.25 
 
 
414 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.15 
 
 
402 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.93 
 
 
403 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
401 aa  360  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.77 
 
 
403 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.62 
 
 
398 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.46 
 
 
403 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.46 
 
 
410 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.15 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.96 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.96 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.07 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.07 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.07 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.94 
 
 
396 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  45.5 
 
 
402 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.33 
 
 
394 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.7 
 
 
405 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.7 
 
 
423 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.7 
 
 
423 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.95 
 
 
410 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.64 
 
 
402 aa  353  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.22 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.56 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.19 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.22 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.45 
 
 
423 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.45 
 
 
423 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.68 
 
 
396 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.45 
 
 
396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.45 
 
 
396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.34 
 
 
408 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.43 
 
 
404 aa  351  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.25 
 
 
422 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  43.99 
 
 
392 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.99 
 
 
401 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.22 
 
 
419 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.73 
 
 
393 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.48 
 
 
404 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.22 
 
 
408 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.81 
 
 
417 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.08 
 
 
397 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.44 
 
 
403 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.12 
 
 
402 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.06 
 
 
401 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  44.14 
 
 
392 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.9 
 
 
406 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.33 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.13 
 
 
413 aa  342  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.52 
 
 
400 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.22 
 
 
411 aa  339  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.52 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.5 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.56 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  45.45 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  40.82 
 
 
397 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.49 
 
 
407 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.46 
 
 
407 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>