37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3132 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  100 
 
 		 510 aa  1047    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  33.66 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  31.19 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  32.11 
 
 		 481 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  30.77 
 
 		 519 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  30.96 
 
 		 481 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  32.51 
 
 		 475 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  32.19 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  30.16 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  30.42 
 
 		 492 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  31.01 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.44 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  30.25 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  29.69 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.35 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  29.9 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  28.54 
 
 		 471 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  28.79 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.54 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  29.11 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  54.29 
 
 		 78 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  29.12 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  25.53 
 
 		 257 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  25.32 
 
 		 234 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  29.12 
 
 		 241 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  22.22 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  21.72 
 
 		 251 aa  50.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  25.11 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  25 
 
 		 244 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  22.86 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  27.98 
 
 		 221 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  22.27 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  21.67 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  27.84 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  27.98 
 
 		 221 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  20.67 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>