More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1057 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 76 aa  159  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  64.94 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  67.14 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  62.69 
 
 		 79 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  69.7 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  55.71 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  62.12 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  55.71 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  58.73 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  59.68 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  56.16 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  56.06 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  59.09 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  56.06 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  48.61 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  57.58 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  57.58 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  57.58 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  52.86 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  56.34 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  56.45 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  58.46 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  56.92 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  56.06 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  54.55 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  46.97 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  51.52 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  58.73 
 
 		 85 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3122  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566659  hitchhiker  0.0000000540295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  56.06 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  51.35 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  53.85 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  51.52 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  51.52 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  52.11 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1264  hypothetical protein  47.69 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000384202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  53.33 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  55.38 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  55.38 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  48.65 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  53.23 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  58.73 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  53.03 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  53.23 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  57.58 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  57.58 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  53.97 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  57.58 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  57.58 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  50.77 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  56.06 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  47.37 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  54.69 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  54.93 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  56.45 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  52.31 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  58.06 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  73.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  55.56 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2368  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  51.61 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0135  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0388939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  53.85 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  56.06 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  54.93 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1566  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154589  normal  0.985446 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  49.3 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  51.52 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  52.38 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>