More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1904 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  52.94 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  37.74 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  33.14 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  33.7 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  31.55 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  33.73 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  30.46 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  34.09 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  31.36 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  33.09 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  31.93 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  32.77 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  32.77 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30.95 
 
 		 172 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  35 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  34.09 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  31.67 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  32.22 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  27.4 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  37.07 
 
 		 416 aa  82  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  32.3 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  32.68 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  32.5 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  28.98 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  27.52 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  28.49 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  34.75 
 
 		 420 aa  78.2  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  30.95 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  33.1 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  24.47 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  33.33 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  30.91 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  33.02 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  33.33 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  27.95 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  26.59 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  32.08 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  32.52 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  26.16 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  26.79 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  24.34 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  27.78 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  29.61 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.23 
 
 		 472 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.65 
 
 		 472 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.77 
 
 		 387 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  31.01 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.29 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  30.37 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  27.1 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  31.01 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.38 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.68 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  28.15 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.89 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.01 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  34.31 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0648  chromate transporter  27.88 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  30.41 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.34 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  30.07 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  26.55 
 
 		 418 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  27.12 
 
 		 418 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  28.75 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  31.43 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.54 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.55 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3336  chromate transporter  30.43 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.82 
 
 		 395 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.33 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.88 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  27.53 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  31.25 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.08 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  28.38 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  31.61 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  31.61 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  30.2 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  27.65 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  31.11 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  23.6 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1208  Chromate transporter  29.57 
 
 		 402 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.51 
 
 		 382 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.17 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  25.74 
 
 		 395 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  29.37 
 
 		 398 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1287  chromate transporter  32.14 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  24.19 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  28.85 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1914  chromate transporter  29.49 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  27.91 
 
 		 403 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2121  chromate transporter  33.33 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728447  normal  0.051785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.69 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  28 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  30.77 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  30.77 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  25.86 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  28 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>