More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1751 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
208 aa  436  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  58.65 
 
 
208 aa  274  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  48.34 
 
 
211 aa  222  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  47.39 
 
 
211 aa  221  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 
211 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  45.97 
 
 
211 aa  210  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 
211 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  45.26 
 
 
191 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  46.45 
 
 
223 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  44.98 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  42.33 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  43.16 
 
 
191 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  43.01 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  41.35 
 
 
206 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  43.39 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  43.19 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  40.74 
 
 
191 aa  161  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
200 aa  160  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
199 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
190 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  40.53 
 
 
191 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  39.04 
 
 
188 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
199 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  40.19 
 
 
208 aa  158  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  42.19 
 
 
194 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.68 
 
 
206 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  40.41 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 
198 aa  154  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  39.69 
 
 
204 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  41.31 
 
 
211 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
204 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  40.85 
 
 
211 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
192 aa  151  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  36.55 
 
 
204 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  36.87 
 
 
207 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  40.19 
 
 
212 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  37.89 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  37.89 
 
 
190 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
190 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
192 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 
205 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  39.15 
 
 
190 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  35.26 
 
 
194 aa  135  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 
189 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  35.98 
 
 
192 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.99 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 
193 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  32 
 
 
189 aa  109  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
193 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  30.93 
 
 
193 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
189 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  32.8 
 
 
186 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
186 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  34.43 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
233 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  34.03 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  32.49 
 
 
197 aa  89  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  33.51 
 
 
197 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 
183 aa  85.1  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  28.57 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  35.38 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  40.38 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  32.92 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  32.46 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  31.32 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  41.75 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  37.98 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  32.68 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  30.05 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  34.11 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  33.06 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  39 
 
 
179 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  35.46 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  38.89 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  39.42 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  38.05 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  35.58 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  30.43 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  35.21 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>