61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0546 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 749 aa  1553    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 697 aa  360  5e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.13 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  32.19 
 
 		 867 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0298  hypothetical protein  26.9 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.78 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 		 166 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00129439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 		 421 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  45.28 
 
 		 59 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 		 156 aa  50.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0087  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  23.37 
 
 		 291 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127818  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1632  NADH dehydrogenase subunit I  39.13 
 
 		 159 aa  49.3  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.285912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1047  ferredoxin  43.4 
 
 		 170 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 		 614 aa  48.5  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1031  iron-sulfur cluster-binding protein  41.18 
 
 		 63 aa  48.5  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.125159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  43.4 
 
 		 60 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 169 aa  47.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.67 
 
 		 67 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 		 485 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 		 596 aa  47.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1786  ferredoxin  35.94 
 
 		 170 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 407 aa  47.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  43.48 
 
 		 428 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  34 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  42.19 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0870  ferredoxin  41.51 
 
 		 170 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00207801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 		 213 aa  46.6  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.86 
 
 		 211 aa  46.2  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 		 610 aa  45.8  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4302  cytochrome b/b6-like  28.42 
 
 		 535 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.103507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0483  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  38 
 
 		 95 aa  45.8  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  36.84 
 
 		 384 aa  45.8  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0516  NADH dehydrogenase subunit I  34.78 
 
 		 155 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  36.96 
 
 		 154 aa  46.2  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.38 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  42.31 
 
 		 219 aa  45.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 292 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0867  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  42 
 
 		 68 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000250696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1057  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  34.29 
 
 		 222 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0044  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.43 
 
 		 63 aa  45.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1423  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.5 
 
 		 166 aa  45.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 		 656 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.33 
 
 		 439 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42 
 
 		 510 aa  45.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.922608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.67 
 
 		 442 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 132 aa  44.7  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1467  iron-sulfur cluster-binding protein  42.22 
 
 		 64 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0638902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.43 
 
 		 436 aa  44.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 		 597 aa  44.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  42.86 
 
 		 70 aa  44.7  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.19 
 
 		 209 aa  44.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1361  Iron-sulfur cluster-binding protein  40.74 
 
 		 64 aa  44.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385025  hitchhiker  0.00000000000102119 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  27.84 
 
 		 620 aa  44.3  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1601  putative oxidoreductase  39.62 
 
 		 615 aa  44.3  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1844  NADP-reducing hydrogenase chain C  28 
 
 		 486 aa  44.3  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1634  NADP-reducing hydrogenase chain C  28 
 
 		 486 aa  44.3  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000096005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  28 
 
 		 486 aa  44.3  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 64 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.22 
 
 		 64 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0270  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 292 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>