89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0483 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0483  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  100 
 
 
95 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0845  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70 
 
 
90 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00124646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0731  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70 
 
 
90 aa  142  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.625841  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  70 
 
 
90 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0091  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  68.89 
 
 
90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
70 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1719  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.18 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.18 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00969866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.84 
 
 
950 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.15 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.9 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1475  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  34.25 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.06 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0637418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1678  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  30.86 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0135618  normal  0.0584624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.78 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1918  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1960  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  33.77 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2003  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1139  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  37.21 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.15 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.56 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.483259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0043  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  32.22 
 
 
81 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.17 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.73 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.89 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.84715  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  34.72 
 
 
1070 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0909  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  34.94 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.495197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 
749 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.66 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  33.33 
 
 
1069 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  35.29 
 
 
517 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.73 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000475008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  33.33 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.14 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1983  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.89 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0686679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0302  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  31.71 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0055  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
515 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.08 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17580  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  36 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0941  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07910  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  32 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00191452  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.78 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1880  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  33.72 
 
 
101 aa  42.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0245187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  34.72 
 
 
307 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16960  4Fe-4S protein  34.62 
 
 
398 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1811  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  33.33 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  31.51 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
517 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0357166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.25 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1052  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  28.92 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0602855  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0639  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.56 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.5 
 
 
665 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.5 
 
 
665 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0026  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  33.82 
 
 
523 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00952912  normal  0.230083 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1395  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.56 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0560  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.56 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0090  heterodisulfide reductase subunit  32.5 
 
 
665 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.078699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.87 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1386  hydrogenases, Fe-only  35.44 
 
 
421 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0057  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.94 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.46083e-34 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1544  ferredoxin  29.33 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0716238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3583  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 
665 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0149  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 
665 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08380  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, gamma subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family/2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family  31.03 
 
 
355 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.198369  normal  0.196547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.43 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.95 
 
 
398 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.51 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1418  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.33 
 
 
314 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0335  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G  28.05 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09610  formate dehydrogenase beta subunit  29.63 
 
 
333 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  31.43 
 
 
736 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1295  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.56 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000492894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  26.32 
 
 
273 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1233  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.51 
 
 
315 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3426  heterodisulfide reductase subunit  32.5 
 
 
665 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 
77 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  32.89 
 
 
288 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333734  normal  0.0379764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>