88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3137 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1719  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  47.06 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00969866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.67 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.65 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.06 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0043  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  44.29 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.71 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
65 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.28 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.59 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1811  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  36.59 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0057  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.48 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.12 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.46083e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.59 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07910  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  39.13 
 
 
70 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00191452  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.35 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1678  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  40 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0135618  normal  0.0584624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  39.71 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1475  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  38.24 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1983  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.93 
 
 
72 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0686679  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  40 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1604  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.28 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1706  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.29 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.8 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1544  ferredoxin  37.14 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.55 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 
65 aa  47.8  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.483259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1918  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0637418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1960  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.5 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2003  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17580  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.68 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.67 
 
 
90 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 
76 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0716238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.29 
 
 
76 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.57 
 
 
118 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2899  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1326  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.14 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000117885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2822  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
708 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.18 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.222018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1467  iron-sulfur cluster-binding protein  38.24 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0638902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0302  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1361  Iron-sulfur cluster-binding protein  38.24 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385025  hitchhiker  0.00000000000102119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.84715  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0845  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00124646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1095  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.121461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0909  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  34.85 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.495197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0867  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.31 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000250696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1626  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453063  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0483  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  33.78 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 
112 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550114  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  38.03 
 
 
516 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.78 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0731  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.49 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.625841  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.24 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000001451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1481  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.57 
 
 
73 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.859312  normal  0.859235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0602  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000173752 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0560  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  33.33 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0639  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  33.33 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.88 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000475008  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1139  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  36.36 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.78 
 
 
307 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1395  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  33.33 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  38.98 
 
 
315 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1052  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  31.65 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0602855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1031  iron-sulfur cluster-binding protein  37.14 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.125159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.22066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  34.72 
 
 
272 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1418  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  36.11 
 
 
314 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1667  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2248  oxoacid ferredoxin oxidoreductase  27.63 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  34.29 
 
 
428 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>