70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0731 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0731  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
90 aa  187  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.625841  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  71.11 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0483  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  70 
 
 
95 aa  142  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0091  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  71.11 
 
 
90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0845  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  68.89 
 
 
90 aa  137  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00124646  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1719  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  43.04 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.04 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00969866  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.04 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.03 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.483259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.71 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.12 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000475008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1418  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  39.51 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  40.28 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.21 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.06 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  34.72 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  37.5 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0302  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.44 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  35.8 
 
 
315 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1233  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  36.11 
 
 
315 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  35.21 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0043  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  38.82 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1139  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  32.56 
 
 
102 aa  47  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 
93 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 
79 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.39 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1475  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0909  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  29.41 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.495197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1678  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  30.86 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0135618  normal  0.0584624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.77 
 
 
950 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.54 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1052  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  24.39 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0602855  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.87 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0637418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0716238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0090  heterodisulfide reductase subunit  32.5 
 
 
665 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.078699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.49 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.43 
 
 
640 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.72 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.46083e-34 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.23 
 
 
425 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0057  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.72 
 
 
1139 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.61 
 
 
369 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.43 
 
 
640 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.07 
 
 
1013 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1811  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  29.41 
 
 
94 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1544  ferredoxin  31.17 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 
665 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
708 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.51 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0030  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.25 
 
 
665 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  31.17 
 
 
272 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30 
 
 
640 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.48 
 
 
209 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0026  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  32.35 
 
 
523 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00952912  normal  0.230083 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1880  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  29.41 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0245187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0811  heterodisulfide reductase subunit  31.08 
 
 
659 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.11 
 
 
371 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17580  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.25 
 
 
68 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 
92 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>