69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1950 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 90 aa  189  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0663684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0845  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.33 
 
 		 90 aa  147  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00124646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0731  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  71.11 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.625841  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0483  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  70 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0091  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  67.78 
 
 		 90 aa  135  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00969866  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1719  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  37.97 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.53 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000175687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.483259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0018  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0689181  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0302  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  32.88 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.77 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000309533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1306  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.78 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000902079  normal  0.0568667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0637418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1862  keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit  31.94 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00222971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.25 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.46083e-34 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0716238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1678  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  30.86 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0135618  normal  0.0584624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.59 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0043  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  34.94 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182494  normal  0.90179 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0635  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  36.25 
 
 		 612 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0480  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  33.78 
 
 		 1070 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1035  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.11 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  33.33 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1544  ferredoxin  28.75 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1918  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2003  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1983  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.84 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0686679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0867  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  33.78 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000250696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2054  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.68 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0694  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.33 
 
 		 307 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.49 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.78 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.84715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  32.43 
 
 		 1069 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1233  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.94 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1960  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  32.47 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 1013 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4012  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  31.94 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0978  Fe-S cluster domain-containing protein  31.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 		 1139 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.18 
 
 		 548 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0057  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.94 
 
 		 83 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 		 73 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1475  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1811  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase, delta subunit  30.14 
 
 		 94 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1358  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 612 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.29 
 
 		 371 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1318  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 612 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  29.58 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1418  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  36.11 
 
 		 314 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0909  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  28.24 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.495197  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0138  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.425374  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  30.14 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  30.56 
 
 		 275 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>