More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09610  formate dehydrogenase beta subunit  100 
 
 
333 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  68.34 
 
 
332 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3576  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  68.53 
 
 
333 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.403029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5601  formate dehydrogenase beta subunit  55.21 
 
 
300 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5221  formate dehydrogenase beta subunit  55.25 
 
 
300 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.848282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5309  formate dehydrogenase beta subunit  55.25 
 
 
300 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19180  formate dehydrogenase beta subunit  56.02 
 
 
337 aa  326  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0039184  normal  0.491864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0345  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.19 
 
 
355 aa  315  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0022  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.73 
 
 
294 aa  311  9e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0823492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  54.49 
 
 
288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333734  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04210  formate dehydrogenase beta subunit  45.97 
 
 
391 aa  294  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.344233  normal  0.126289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2725  formate dehydrogenase beta subunit  52.51 
 
 
312 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00195593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0875  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.3 
 
 
310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0871  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.3 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0823  formate dehydrogenase beta subunit  51.16 
 
 
310 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.33 
 
 
309 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0491608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.13 
 
 
270 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2180  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.88 
 
 
264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0611  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.27 
 
 
279 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2292  formate dehydrogenase beta subunit  43.23 
 
 
260 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317566  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5827  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.47 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.92 
 
 
376 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.622574  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0826  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.72 
 
 
290 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.456619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2592  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.92 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3378  formate dehydrogenase, beta subunit  36.42 
 
 
304 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749557  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3880  formate dehydrogenase, beta subunit  36.42 
 
 
304 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.670171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2099  formate dehydrogenase beta subunit  36.1 
 
 
304 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0708  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4381  formate dehydrogenase, beta subunit  36.1 
 
 
304 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3985  formate dehydrogenase, beta subunit  36.1 
 
 
304 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.93 
 
 
271 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3543  formate dehydrogenase, beta subunit  36.1 
 
 
304 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0467052  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1682  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0729  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1693  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1900  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2395  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2258  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0572  formate dehydrogenase, beta subunit  35.58 
 
 
304 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0383957  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4596  formate dehydrogenase, beta subunit  36.1 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247951  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1738  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.87 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01433  formate dehydrogenase-N, Fe-S (beta) subunit, nitrate-inducible  34.87 
 
 
294 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01445  hypothetical protein  34.87 
 
 
294 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1683  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.21 
 
 
292 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2087  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  35.2 
 
 
292 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1774  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.21 
 
 
294 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0796568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1685  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.21 
 
 
294 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1596  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.21 
 
 
294 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1746  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.21 
 
 
294 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2172  formate dehydrogenase, beta subunit  34.54 
 
 
294 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.402414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1428  formate dehydrogenase, beta subunit  33.75 
 
 
300 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1657  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.54 
 
 
294 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1699  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.54 
 
 
294 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.808171  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2182  formate dehydrogenase, beta subunit  34.54 
 
 
294 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03820  formate dehydrogenase, beta subunit  36.52 
 
 
297 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1558  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  34.54 
 
 
294 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2053  formate dehydrogenase beta subunit  35.08 
 
 
294 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0533  formate dehydrogenase, beta subunit  34.7 
 
 
316 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0524  formate dehydrogenase, beta subunit  34.37 
 
 
316 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0490  formate dehydrogenase, beta subunit  34.37 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2699  formate dehydrogenase beta subunit  34.37 
 
 
311 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1824  formate dehydrogenase beta subunit  32.51 
 
 
270 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2518  formate dehydrogenase, beta subunit  33.54 
 
 
300 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.583749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3262  formate dehydrogenase, beta subunit  33.73 
 
 
305 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4519  formate dehydrogenase, beta subunit  33.97 
 
 
312 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1091  formate dehydrogenase, beta subunit  34.63 
 
 
311 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3046  formate dehydrogenase, beta subunit  32.8 
 
 
302 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1285  formate dehydrogenase, beta subunit  32.8 
 
 
302 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.519399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4125  formate dehydrogenase, beta subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03778  formate dehydrogenase-O, Fe-S subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4091  formate dehydrogenase, beta subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4279  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03727  hypothetical protein  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4422  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4372  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4121  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5343  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.23 
 
 
300 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.82838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2090  formate dehydrogenase beta subunit  31.69 
 
 
300 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4427  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  35.52 
 
 
300 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0545  formate dehydrogenase, beta subunit  34.06 
 
 
318 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4086  formate dehydrogenase beta subunit  33.33 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.681709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4271  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  35.17 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4316  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  35.17 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0085  formate dehydrogenase, beta subunit  34.17 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5530  nitrate-inducible formate dehydrogenase subunit beta  34.6 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4249  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  35.17 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1751  formate dehydrogenase beta subunit  32.89 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.587203  hitchhiker  0.00082122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3769  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  34.29 
 
 
323 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0039  formate dehydrogenase, beta subunit  34.29 
 
 
323 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63580  nitrate-inducible formate dehydrogenase, beta subunit  33.95 
 
 
309 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4118  putative aerobic formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  34.29 
 
 
323 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3895  formate dehydrogenase, beta subunit  34.98 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3811  formate dehydrogenase, beta subunit  34.98 
 
 
291 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1574  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  33.1 
 
 
262 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3489  formate dehydrogenase, beta subunit  35.35 
 
 
309 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3755  formate dehydrogenase beta subunit  33.99 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4362  formate dehydrogenase-O iron-sulfur subunit  34.83 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1209  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  35 
 
 
290 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.796434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.34 
 
 
258 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2552  formate dehydrogenase beta subunit  34.59 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>