66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0961 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
407 aa  822    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.89 
 
 
453 aa  229  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0955  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.46 
 
 
463 aa  222  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157749  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.6 
 
 
836 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2619  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.87 
 
 
468 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.912572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2892  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.43 
 
 
537 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3880  hypothetical protein  26.79 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  23.2 
 
 
428 aa  103  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.86 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.84 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.24 
 
 
867 aa  80.1  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0783  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  25.26 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00366682  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  20.82 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  24.32 
 
 
440 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.08 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.63 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  21.95 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  20.41 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.37 
 
 
697 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  20.31 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  21.28 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  20.87 
 
 
396 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4481  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  20.25 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0662  coenzyme F420 hydrogenase beta subunit  23.38 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.85 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.85 
 
 
375 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.19 
 
 
623 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
57 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  21.13 
 
 
538 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.1 
 
 
167 aa  47.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
169 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 
749 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  27.27 
 
 
375 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.05 
 
 
428 aa  46.6  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.99 
 
 
91 aa  46.6  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  33.82 
 
 
156 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  37.31 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  27.61 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.88 
 
 
135 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.68 
 
 
56 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
598 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2129  iron-sulfur cluster binding protein  37.1 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
132 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.14 
 
 
58 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0708  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3038  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  19.82 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  31.94 
 
 
198 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
62 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
55 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  32.79 
 
 
134 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1693  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.15 
 
 
340 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.884047  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  30.99 
 
 
192 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  34.33 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
588 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 
361 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.48 
 
 
132 aa  43.9  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  29.87 
 
 
206 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 
595 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  33.93 
 
 
57 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0852  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  27.63 
 
 
280 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  34.33 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  34.33 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.96 
 
 
369 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  25.77 
 
 
229 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>