84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0545 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 697 aa  1447    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 749 aa  360  5e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2548  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.85 
 
 		 399 aa  230  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  34.91 
 
 		 867 aa  196  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.55 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  24.62 
 
 		 428 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2944  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  22.52 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.05 
 
 		 395 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.31 
 
 		 836 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.37 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.12 
 
 		 421 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 132 aa  50.8  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  27.71 
 
 		 346 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 		 620 aa  50.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  36.36 
 
 		 166 aa  48.9  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  25 
 
 		 343 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.47 
 
 		 432 aa  48.5  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0654  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  27.33 
 
 		 654 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.558651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 		 610 aa  48.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1185  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 202 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.150574  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  28.69 
 
 		 485 aa  47.8  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.44 
 
 		 166 aa  47.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 132 aa  47.4  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.62 
 
 		 453 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0068  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 654 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.829089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.47 
 
 		 432 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1883  ferredoxin hydrogenase  33.33 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0955  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 		 596 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2106  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.46 
 
 		 203 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0332  NADH dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 		 629 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  41.3 
 
 		 156 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  24.49 
 
 		 594 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1423  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.29 
 
 		 166 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  25.49 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1972  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.74 
 
 		 229 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.555312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  39.22 
 
 		 58 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 233 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.28 
 
 		 285 aa  46.6  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  35.82 
 
 		 219 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.51 
 
 		 153 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2979  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.31 
 
 		 65 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 180 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 180 aa  45.8  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  42 
 
 		 171 aa  45.8  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 180 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2511  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.28 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0573  hypothetical protein  36.54 
 
 		 198 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.575358  decreased coverage  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 		 180 aa  45.8  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3013  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 1006 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672431  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 1006 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0694  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42 
 
 		 228 aa  45.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.244067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0629  coenzyme F420 hydrogenase  42 
 
 		 228 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.871927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 173 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 		 171 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 607 aa  45.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0750  hydrogenase large subunit  37.14 
 
 		 482 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0180769  hitchhiker  0.000000000087178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1176  glycyl-radical activating protein  30.3 
 
 		 306 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 		 607 aa  45.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0194  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  42 
 
 		 228 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1289  coenzyme F420 hydrogenase, subunit gamma  42 
 
 		 228 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 		 57 aa  44.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 		 167 aa  44.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 314 aa  44.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 229 aa  44.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.62 
 
 		 153 aa  44.3  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.78 
 
 		 170 aa  44.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 		 171 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38 
 
 		 777 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0358  iron-sulfur cluster-binding protein  36.67 
 
 		 141 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0378692  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.89 
 
 		 166 aa  44.3  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00129439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  37.74 
 
 		 59 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  38 
 
 		 178 aa  44.3  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.74 
 
 		 147 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  37.78 
 
 		 169 aa  43.9  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.78 
 
 		 114 aa  43.9  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000582255  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.41 
 
 		 128 aa  43.9  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  28.45 
 
 		 604 aa  43.9  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.25 
 
 		 368 aa  43.9  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  41.67 
 
 		 226 aa  43.9  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.95 
 
 		 355 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.28 
 
 		 411 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>