59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0828 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 836 aa  1743    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.57 
 
 		 453 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0955  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.43 
 
 		 463 aa  552  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2619  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  35.13 
 
 		 468 aa  261  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.912572  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3880  hypothetical protein  38.32 
 
 		 459 aa  243  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 407 aa  201  5e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2892  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  33.42 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  31.77 
 
 		 428 aa  168  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.18 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3613  hypothetical protein  29.21 
 
 		 320 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.06 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4481  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.68 
 
 		 418 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  26.09 
 
 		 440 aa  73.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  27.4 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0662  coenzyme F420 hydrogenase beta subunit  27.97 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2944  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.76 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  30.74 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  29.32 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0174  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  27.42 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.318509  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  26.13 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3646  hypothetical protein  26.24 
 
 		 908 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.31 
 
 		 697 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1693  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.63 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.884047  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  28.64 
 
 		 498 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  20.24 
 
 		 867 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  27.57 
 
 		 396 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.72 
 
 		 618 aa  54.7  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0866  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.27 
 
 		 359 aa  54.3  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.161905  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0783  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  25.11 
 
 		 337 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00366682  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0881  coenzyme F420 hydrogenase, beta subunit  22.83 
 
 		 387 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  22.38 
 
 		 389 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0477  coenzyme F420 hydrogenase  37.5 
 
 		 252 aa  53.5  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.92 
 
 		 339 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 147 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.712445  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1081  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.02 
 
 		 359 aa  51.2  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1595  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.02 
 
 		 359 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2330  coenzyme F420 hydrogenase  37.93 
 
 		 262 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1150  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  27.16 
 
 		 364 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2176  coenzyme F420 hydrogenase  38.46 
 
 		 263 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  26.57 
 
 		 538 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0086  coenzyme F420 hydrogenase, subunit gamma  41.07 
 
 		 253 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0290511  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1303  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.41 
 
 		 357 aa  47  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.808254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.48 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0194  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  39.29 
 
 		 228 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0629  coenzyme F420 hydrogenase  39.29 
 
 		 228 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.871927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1289  coenzyme F420 hydrogenase, subunit gamma  39.29 
 
 		 228 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 76 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.96 
 
 		 421 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1043  coenzyme F420 hydrogenase  42.86 
 
 		 227 aa  45.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0694  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.5 
 
 		 228 aa  45.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.244067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0012  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  25 
 
 		 290 aa  44.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0694  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.65 
 
 		 267 aa  44.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 		 598 aa  44.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  23.96 
 
 		 639 aa  44.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 77 aa  44.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0105  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 73 aa  44.3  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0171848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0450  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  38.46 
 
 		 293 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0647  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  39.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0932  ferredoxin  38.98 
 
 		 170 aa  44.3  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>