More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1700 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  78.22 
 
 		 406 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  78.52 
 
 		 411 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 406 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  78.96 
 
 		 406 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  81.73 
 
 		 406 aa  656    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  77.48 
 
 		 403 aa  620  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  77.07 
 
 		 377 aa  584  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  48.58 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  41.48 
 
 		 408 aa  319  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  42.23 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  44.92 
 
 		 408 aa  312  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  42.25 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  41.99 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  39.63 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  42.09 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  40.62 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  39.13 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  41 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  41.71 
 
 		 373 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  41.53 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  42.86 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  41.94 
 
 		 371 aa  285  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  43.25 
 
 		 374 aa  285  9e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  42.19 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  42.74 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  40.37 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  41.02 
 
 		 376 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  41.4 
 
 		 377 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  40.38 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  41.67 
 
 		 377 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  42.9 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  42.62 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  42.9 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  40.44 
 
 		 366 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  42.62 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  41.76 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  40.59 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  41.13 
 
 		 377 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  41.18 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  41.18 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  41.03 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  40.5 
 
 		 376 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 371 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  43.8 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  41.1 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  40.88 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  43.44 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  40.33 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  40.33 
 
 		 371 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  40.33 
 
 		 371 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  40.87 
 
 		 373 aa  266  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  40.61 
 
 		 371 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  40.54 
 
 		 370 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  40.81 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  40.54 
 
 		 370 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  41.02 
 
 		 371 aa  262  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  38.94 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  43.02 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  43.63 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  38.54 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  39.89 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  38.01 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  44.23 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  41.44 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  44.2 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  39.44 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  43.96 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  39.89 
 
 		 371 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  40.25 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  40.25 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  37.74 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  41.16 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  38.11 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  39.14 
 
 		 370 aa  255  8e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  40.91 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  39.06 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  39.89 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  36.9 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  38.1 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  42.38 
 
 		 371 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  37.94 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  39.39 
 
 		 371 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  38.92 
 
 		 371 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  42.14 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  40.39 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  41.67 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>