113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1489 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  100 
 
 
181 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  75.19 
 
 
135 aa  223  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  72.52 
 
 
132 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  72.39 
 
 
134 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  71.97 
 
 
135 aa  204  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  72.66 
 
 
135 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  65.38 
 
 
133 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  52.99 
 
 
134 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  52.24 
 
 
135 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  51.49 
 
 
135 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  50.38 
 
 
134 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  50.76 
 
 
134 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  45.38 
 
 
135 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  48.57 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  38.58 
 
 
735 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  34.29 
 
 
742 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  34.29 
 
 
742 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  34.29 
 
 
742 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  35.43 
 
 
728 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  34.65 
 
 
729 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  34.65 
 
 
728 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  34.65 
 
 
729 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  34.65 
 
 
729 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  37.4 
 
 
728 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  37.4 
 
 
728 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  34.65 
 
 
729 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  36.59 
 
 
728 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  36.59 
 
 
728 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  36.59 
 
 
732 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  33.86 
 
 
728 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  33.86 
 
 
728 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  34.65 
 
 
727 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  34.65 
 
 
728 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  33.6 
 
 
728 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  36.59 
 
 
731 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  36.59 
 
 
734 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  33.86 
 
 
728 aa  91.3  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  33.07 
 
 
728 aa  90.9  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  34.4 
 
 
728 aa  90.9  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  34.96 
 
 
734 aa  90.5  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  35.77 
 
 
734 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  32.28 
 
 
728 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  34.96 
 
 
734 aa  88.2  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  34.15 
 
 
734 aa  85.1  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  31.09 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  29.51 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  24.81 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  28.23 
 
 
133 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  24.22 
 
 
138 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  28.69 
 
 
127 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  24.8 
 
 
134 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  27.03 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  26.83 
 
 
248 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  27.27 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  29.91 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  29.91 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  29.91 
 
 
130 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  29.91 
 
 
130 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  29.91 
 
 
130 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  29.91 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  29.63 
 
 
130 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  25 
 
 
138 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  26.92 
 
 
134 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  28.83 
 
 
133 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  26.92 
 
 
134 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  29.17 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  25.49 
 
 
129 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  28.12 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  23.47 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  25.96 
 
 
134 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  27.93 
 
 
133 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  37.31 
 
 
145 aa  51.2  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  23.23 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25 
 
 
415 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  25.93 
 
 
412 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  26.14 
 
 
133 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  26.13 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  23.16 
 
 
138 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  23.08 
 
 
402 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  25 
 
 
133 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  27.55 
 
 
135 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  22.94 
 
 
410 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  22.94 
 
 
410 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  32.81 
 
 
137 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  23.85 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  24.07 
 
 
409 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  22.12 
 
 
407 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  22.73 
 
 
133 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  26.67 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  22.12 
 
 
407 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  32.93 
 
 
150 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  21.13 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  26.52 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1531  OsmC family protein  35.9 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  20.56 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  25 
 
 
405 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  30.51 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  24.22 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  21.36 
 
 
397 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>