More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1237 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  64.91 
 
 		 228 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  63.16 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  59.21 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  58.77 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  58.9 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  55.26 
 
 		 228 aa  255  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  48.25 
 
 		 232 aa  224  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  43.86 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  44.44 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  40.28 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.54 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  38.8 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  34.95 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  40.51 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.35 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  31.53 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  32.38 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  43.2 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  36.9 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  37.95 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  34.08 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.21 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.8 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  31.67 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  34.78 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  36.08 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  41.62 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  31.67 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  32.68 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  31.67 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  34.69 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  32.95 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  30.22 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  35.54 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  32.45 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  33.14 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  29.56 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  35.93 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  34.94 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  30.89 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  33.53 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  33.01 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  34.34 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.21 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  34.54 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  34.54 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  31.91 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  33.54 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  29.36 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  32.02 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.68 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.1 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.85 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.95 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  32.02 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  33.68 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  28.08 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>