275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0290 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0290  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  70.65 
 
 		 214 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  62.76 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  69.02 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  62.31 
 
 		 222 aa  254  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  64.82 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  62.7 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  49.19 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  49.47 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  51.11 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  48.3 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  48.86 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  43.82 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  53.66 
 
 		 672 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  47.37 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  44.51 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  52.2 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  51.55 
 
 		 188 aa  154  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  51.25 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  51.25 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  51.25 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  46.11 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  49.37 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  44.5 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  48.17 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  48.17 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  46.71 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  51.66 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  49.67 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  43.09 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  48.77 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  39.47 
 
 		 195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  47.53 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  41.38 
 
 		 194 aa  146  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  44.65 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  44.15 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 186 aa  144  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  46.88 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  49.39 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  46.88 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  48.41 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  42.41 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  46.7 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  44.58 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  40.44 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  45.81 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  46.25 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  44.57 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  43.55 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  40.99 
 
 		 193 aa  138  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  38.97 
 
 		 280 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  40.32 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  43.58 
 
 		 650 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  48.73 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  38.31 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  50.33 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  46.62 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  43.52 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  38.42 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  47.59 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  46.5 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  38.95 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  41.53 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  39.18 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  40.72 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  44.08 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  42.59 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>