More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1822 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  100 
 
 		 302 aa  606  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  68.32 
 
 		 306 aa  424  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  66.01 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  62.71 
 
 		 302 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  62.71 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  63.37 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  61.72 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  65.02 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  60.73 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  64.36 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  64.36 
 
 		 305 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  59.41 
 
 		 306 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  60.2 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  61.95 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  63.04 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  62.05 
 
 		 305 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  58.67 
 
 		 306 aa  349  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  58.33 
 
 		 305 aa  342  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  56.44 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.78 
 
 		 312 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  55.63 
 
 		 311 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.04 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  56 
 
 		 305 aa  315  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  56.95 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.88 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.88 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  55.18 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  55.67 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.05 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  55.81 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  57.43 
 
 		 307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  56.23 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 311 aa  302  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  51.16 
 
 		 311 aa  301  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  54.1 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  53.49 
 
 		 308 aa  299  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 307 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  48.84 
 
 		 304 aa  298  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.34 
 
 		 304 aa  298  5e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  55.74 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  55.41 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  55.41 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  55.41 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  55.52 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  50.67 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  52 
 
 		 302 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  53 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.15 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  51.18 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 301 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  53.18 
 
 		 310 aa  291  9e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  50.17 
 
 		 307 aa  291  9e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  52.65 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  50.5 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  52.17 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  52.17 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  50.67 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  49.68 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  50.17 
 
 		 317 aa  285  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  49.49 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  52.32 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  53 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  49.5 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  53.85 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  51.16 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  51.82 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  53.51 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  51.97 
 
 		 316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  52.32 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  53.49 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  47.51 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  51.99 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.17 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  49.01 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  50.5 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  53.92 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  51.54 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  49.67 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  53 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  52.84 
 
 		 311 aa  278  8e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  51.62 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  52.84 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  52.33 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  50 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  51.71 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  52.03 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  51 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  49.67 
 
 		 320 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  51.51 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  51.67 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  51.66 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>