89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1162 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1162  major facilitator transporter  100 
 
 
395 aa  777    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2108  major facilitator superfamily MFS_1  54.67 
 
 
383 aa  421  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0310  major facilitator transporter  44.65 
 
 
366 aa  306  3e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0036  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 
390 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0606138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  26.25 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  26.25 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  25.13 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  23.45 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
406 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  23.7 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  22.82 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  29.79 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  22.82 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  24.35 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  22.72 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  23.32 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
400 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  28.28 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  23.14 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
455 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.63 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  26.29 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  33.57 
 
 
406 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  25.7 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  28.03 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  30 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  30.36 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  23.87 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  24.23 
 
 
400 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  22.88 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  26.18 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  25.36 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  23.42 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  29.19 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  23.54 
 
 
404 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  31.5 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  25.77 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  21.99 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  26.28 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  23.5 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  25.32 
 
 
399 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  21.39 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  29.01 
 
 
429 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  23.31 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.07 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  22.82 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  20.56 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  30.89 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
385 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
403 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  21.85 
 
 
389 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  26.97 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  27.05 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  26.58 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  27.04 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  25.17 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  24.83 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  25.53 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  22.63 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  27.61 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  25.95 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  25.95 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  25.95 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.57 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  25.95 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  21.09 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.53 
 
 
429 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  21.4 
 
 
387 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.92 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  26.87 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  22.42 
 
 
401 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  25.79 
 
 
222 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.58 
 
 
418 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  25.52 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>