More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0432 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 331 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  84.89 
 
 		 338 aa  557  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  60.43 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  45.79 
 
 		 327 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 331 aa  298  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  41.8 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  36.82 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  34.11 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  34.5 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  36.5 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  35.98 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  38.89 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  35.71 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  34.6 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  34.08 
 
 		 317 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  36.51 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  27.49 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.83 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  35.94 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  32.01 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 		 302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  31.69 
 
 		 302 aa  146  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  36.21 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  32.71 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  33.2 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.84 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  35.16 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  35.16 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  29.11 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  35.55 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  37.25 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  25.77 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  34.96 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 285 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  27.71 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  32.81 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  26.25 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  29.52 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.55 
 
 		 293 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.41 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  27.14 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1119  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.194456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  29.3 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 		 285 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>