35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0113 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  87.91 
 
 		 96 aa  166  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  87.78 
 
 		 96 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  82.35 
 
 		 86 aa  148  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  76.67 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  80 
 
 		 83 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  36.67 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  40.66 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  37.23 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  34.09 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  40 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  34.83 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  40.96 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  31.4 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 97 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  35.37 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  30.12 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  27.78 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 99 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>