45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3623 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  56.9 
 
 
124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.55 
 
 
122 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  44.55 
 
 
130 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  43.24 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.44 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  36.44 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  31.73 
 
 
645 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  37.14 
 
 
749 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  32.94 
 
 
659 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  35.71 
 
 
671 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
662 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  34.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  28.57 
 
 
662 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  29.63 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  25.93 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  43.55 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  31.82 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  32.2 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  28.99 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.31 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  45.9 
 
 
332 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  32.2 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  32.2 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  30.7 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  32.2 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  32.2 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.79 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  29.73 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 
372 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  24.36 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>