73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11620 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11620  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  71.91 
 
 		 89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  51.16 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  44.94 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  45.45 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  43.53 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  43.18 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0156  hypothetical protein  43.82 
 
 		 88 aa  76.6  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.936337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  44.71 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  38.64 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  43.82 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  39.77 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  47.25 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  40.45 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1019  hypothetical protein  40.45 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  42.53 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  39.77 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  39.08 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1031  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  45.24 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05450  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.670978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  40.91 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  39.77 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  44.58 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  39.77 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4121  ACT domain-containing protein  39.33 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0861831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  37.08 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  38.64 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  37.08 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  36.36 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  34.83 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  45.24 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  39.77 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1174  ACT domain protein  38.2 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.440111 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  32.58 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0912  hypothetical protein  44.05 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.187165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  47.62 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.46 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.46 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  39.13 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  48.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  46 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  36.51 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.11 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 		 317 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.9 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  33.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  31.25 
 
 		 400 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  37.33 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 		 324 aa  43.9  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  35.62 
 
 		 404 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  46.67 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  29.76 
 
 		 398 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3185  glycine cleavage system transcriptional repressor  30.26 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1251  formyl transferase domain protein  33.78 
 
 		 327 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  33.77 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  35.14 
 
 		 404 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  44.44 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02138  glycine cleavage system transcriptional repressor  40 
 
 		 187 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  37.14 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  38.16 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2645  formyl transferase domain protein  32.43 
 
 		 316 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  32.43 
 
 		 291 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  42.22 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>