More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10270 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  80.41 
 
 		 536 aa  895    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 530 aa  1089    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  77.1 
 
 		 529 aa  852    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  81.72 
 
 		 535 aa  899    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  56.27 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  54.42 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  54.23 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  55.77 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.83 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  55.66 
 
 		 534 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  53.74 
 
 		 507 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  54.24 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.64 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.08 
 
 		 512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  55.77 
 
 		 556 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  55.2 
 
 		 527 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  53.85 
 
 		 506 aa  558  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  53.33 
 
 		 520 aa  558  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.63 
 
 		 511 aa  561  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  54.38 
 
 		 523 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.85 
 
 		 513 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  51.92 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  52.12 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  51.73 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  52.12 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  52.69 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  52.12 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  52.46 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  54.81 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.01 
 
 		 510 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  54.41 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  52.31 
 
 		 512 aa  558  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  53.3 
 
 		 518 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  52.12 
 
 		 512 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  52.08 
 
 		 517 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  54.46 
 
 		 514 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  51.89 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  51.92 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  52.27 
 
 		 516 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  54.11 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  52.12 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  51.92 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  51.72 
 
 		 517 aa  554  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  52.46 
 
 		 516 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  54.03 
 
 		 522 aa  552  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  51.24 
 
 		 508 aa  554  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  51.34 
 
 		 511 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  54.03 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  54.27 
 
 		 517 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  51.12 
 
 		 540 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  50.37 
 
 		 575 aa  548  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  53.48 
 
 		 535 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.23 
 
 		 575 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  52.96 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  51.92 
 
 		 513 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  52.59 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  53.88 
 
 		 517 aa  547  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.15 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  50.66 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  50.66 
 
 		 542 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  53.31 
 
 		 520 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  51.43 
 
 		 520 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  51.35 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  50.86 
 
 		 514 aa  544  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  51.35 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  51.9 
 
 		 528 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  51.58 
 
 		 528 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  52.7 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  49.72 
 
 		 542 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  52.88 
 
 		 529 aa  544  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  54.23 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  53.32 
 
 		 519 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  51.43 
 
 		 533 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  53.41 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  50.47 
 
 		 537 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  50.96 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  53.12 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  52.93 
 
 		 520 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.11 
 
 		 526 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  51.14 
 
 		 528 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  50.38 
 
 		 517 aa  536  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  52.36 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  50.75 
 
 		 528 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  53.23 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  51.24 
 
 		 560 aa  531  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  52.81 
 
 		 523 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  54.18 
 
 		 510 aa  531  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  52.22 
 
 		 529 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  51.81 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  50.37 
 
 		 528 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  49.91 
 
 		 528 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  52.73 
 
 		 533 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  52.57 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  50.86 
 
 		 560 aa  528  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  52.84 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  50.19 
 
 		 509 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  53.32 
 
 		 517 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  51.24 
 
 		 533 aa  525  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.4 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  52.44 
 
 		 527 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>