More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07270 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  100 
 
 
144 aa  300  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.29 
 
 
118 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13390  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  50 
 
 
300 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.52 
 
 
126 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.19658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1523  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.45 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.27 
 
 
132 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.740591  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.02 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.06 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  38.21 
 
 
122 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2649  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.37 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.59 
 
 
143 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1746  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.2 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117316  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3366  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.58 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  38.95 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.04 
 
 
167 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.94 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  34.86 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.48 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  32.76 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  32.14 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  31.62 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  28.57 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.94 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
173 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.03 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  33.33 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  30.77 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.31 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.92 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.94 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.46 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  34.95 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  35.24 
 
 
615 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  33.94 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.95 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.01 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  36 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.71 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.32 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
194 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  34.78 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  34 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.65 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.03 
 
 
247 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.65 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  30.97 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.11 
 
 
254 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.19 
 
 
175 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.96 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.43 
 
 
229 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  30.77 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
208 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
218 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
208 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1188  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.64 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  30.28 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
208 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
208 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
218 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
215 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.14 
 
 
226 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
193 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
210 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
202 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
200 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
193 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.23 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
218 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.16 
 
 
300 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
215 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.96 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.48 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  30.69 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  30.36 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  30 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  29.81 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4107  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  41.18 
 
 
290 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.975487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  29.81 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.52 
 
 
104 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0840817  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  30.77 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  29.81 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  29.46 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0657  NADH dehydrogenase subunit I  34.72 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0786  ech hydrogenase subunit F  30.77 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>