More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1668 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
133 aa  274  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.56 
 
 
130 aa  137  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1523  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.17 
 
 
131 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3366  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48 
 
 
124 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.53 
 
 
126 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0786  ech hydrogenase subunit F  44.33 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  43.33 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  48.39 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.72 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  42.86 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_771  hydrogenase, EchF subunit  43.3 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2649  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.33 
 
 
124 aa  85.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.18 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.59 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.19658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.71 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.51 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.62 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.740591  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1103  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.94 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.71 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0840817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.01 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.57 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1746  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.9 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117316  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13390  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  40 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  39.76 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.7 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  36.17 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  36.17 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 
208 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 
208 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  37.78 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 
210 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  36.67 
 
 
215 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  37.23 
 
 
218 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  39.29 
 
 
218 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  36.17 
 
 
202 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  39.29 
 
 
218 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2049  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.33 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0933914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1736  putative oxidoreductase  40 
 
 
615 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.6 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.05 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.27 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.05 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.17 
 
 
183 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3407  F420H2 dehydrogenase subunit I  31.63 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00224717  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.26 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.42 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  41.18 
 
 
677 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  35.58 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.26 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.78 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  33.65 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.07 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  34.65 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  34.65 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  30.84 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.78 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  29.73 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  31.73 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  31.82 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  34.09 
 
 
162 aa  53.9  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  28.46 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  32.67 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  28.46 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  32.95 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  34.48 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  34.48 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  32.67 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.87 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.178845  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2276  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.9 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0276213  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.58 
 
 
507 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1292  F420H2 dehydrogenase subunit I  32.65 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000020121  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.47 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.792307 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.04 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32 
 
 
135 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
273 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.93 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  33.33 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  30.09 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.93 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>