279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13390  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  100 
 
 
300 aa  591  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.43 
 
 
118 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07270  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  56.38 
 
 
144 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.194831  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0029  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.57 
 
 
132 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.740591  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3019  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.1 
 
 
128 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3366  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.02 
 
 
124 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1735  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.49 
 
 
120 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.19658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1746  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.84 
 
 
126 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117316  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.82 
 
 
126 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0147  ech hydrogenase subunit F  40.35 
 
 
122 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0802  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.09 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  35.48 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 
137 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.389244  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.36 
 
 
125 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2649  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.01 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1523  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
133 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44 
 
 
130 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.9 
 
 
104 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0840817  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0868  hydrogenase, EchF subunit, putative  32.35 
 
 
114 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.246901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.51 
 
 
127 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_771  hydrogenase, EchF subunit  30.39 
 
 
114 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2679  putative polyferredoxin  32.74 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2766  putative polyferredoxin  32.74 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  36.46 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.92 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2722  putative polyferredoxin  32.69 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  32.48 
 
 
211 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2897  putative polyferredoxin  33.01 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2785  putative polyferredoxin  33.01 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.68 
 
 
167 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  36.73 
 
 
163 aa  52.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  28.06 
 
 
173 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.5 
 
 
168 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  34.74 
 
 
218 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  26.32 
 
 
177 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.11 
 
 
140 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  35.96 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  26.97 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  30.71 
 
 
171 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.52 
 
 
165 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  34.74 
 
 
208 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36.05 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0786  ech hydrogenase subunit F  29.13 
 
 
114 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  31.93 
 
 
183 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.48 
 
 
131 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  31.43 
 
 
202 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  30.48 
 
 
175 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.62 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
208 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  29.94 
 
 
176 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36.46 
 
 
208 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
217 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.69 
 
 
132 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.12 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  46.81 
 
 
677 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  31.09 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 
840 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  32.48 
 
 
132 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.44 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.69 
 
 
135 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.8 
 
 
165 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  34.69 
 
 
200 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  30.33 
 
 
174 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3522  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  30.33 
 
 
174 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  30.33 
 
 
174 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  37.78 
 
 
189 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  27.05 
 
 
199 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
119 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.81 
 
 
254 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  29.31 
 
 
185 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.08 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.72 
 
 
507 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  30.17 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  33.67 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  33.67 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28.95 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
211 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  25.79 
 
 
188 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  27.69 
 
 
199 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.45 
 
 
194 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  28.12 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  30.91 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.71 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  28 
 
 
165 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  27.49 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2619  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I  30.11 
 
 
427 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487115  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  35.58 
 
 
189 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  32.65 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.93 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.65 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.65 
 
 
180 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  32.65 
 
 
180 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>