More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04110 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04110  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 516 aa  1066    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.646858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1171  histidine kinase  38.49 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0926  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 431 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3808  putative lantibiotic biosynthesis sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 454 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3612  lantibiotic biosynthesis sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3899  lantibiotic biosynthesis sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4751  sensor histidine kinase  26.93 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 539 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  25.37 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  29.69 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  26.35 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  32.16 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  22.98 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  25.34 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 484 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  25.34 
 
 		 484 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 471 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  24.91 
 
 		 484 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  22.99 
 
 		 389 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 443 aa  90.1  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.07 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.07 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.07 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 474 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 457 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  28.23 
 
 		 527 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  27.71 
 
 		 449 aa  87  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  29.75 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 461 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  29.07 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.21 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  32.19 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3010  histidine kinase  26.73 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.335446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 949 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  25.54 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  28.22 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  28.22 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 575 aa  84  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  29.32 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05740  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  25.16 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  25.16 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.03 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 944 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 944 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  26.19 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 475 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  28.52 
 
 		 544 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  27.09 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.33 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  28.76 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  26.98 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.3 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  25.78 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  28.68 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.03 
 
 		 601 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.37 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 463 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.17 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  24.7 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.484576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  22.12 
 
 		 473 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  28.95 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  27.03 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  28.06 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  27.91 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>