More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1327 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
227 aa  474  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  58.18 
 
 
226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.22 
 
 
233 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.87 
 
 
229 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.46 
 
 
236 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.05 
 
 
236 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
263 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.48 
 
 
247 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 
238 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.88 
 
 
243 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  42.48 
 
 
220 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.05 
 
 
263 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.71 
 
 
265 aa  99.4  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  26.05 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.87 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  37.07 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  39.68 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.4 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  36.51 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  32.85 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2673  tRNA pseudouridine synthase B  30.57 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1876  domain of unknown function DUF1730  37.5 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  31.9 
 
 
404 aa  65.5  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  28.05 
 
 
354 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  27.69 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1699  domain of unknown function DUF1730  34.45 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  36.51 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  34.35 
 
 
385 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  30.25 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  27.65 
 
 
361 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  31.75 
 
 
514 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  35.83 
 
 
550 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  31.75 
 
 
514 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00099  iron-sulfur cluster-binding protein  32.56 
 
 
375 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  35.71 
 
 
312 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  32.8 
 
 
383 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  26.2 
 
 
374 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0830  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.51 
 
 
428 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  29.57 
 
 
347 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  31.54 
 
 
383 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.51 
 
 
484 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  27.81 
 
 
362 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  27.81 
 
 
362 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  32.03 
 
 
317 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1104  hypothetical protein  31.45 
 
 
363 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0111138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3526  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.83 
 
 
398 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.51 
 
 
474 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  33.33 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  29.68 
 
 
399 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  30.23 
 
 
365 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  33.06 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2753  iron-sulfur cluster-binding protein  31.78 
 
 
369 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.95 
 
 
282 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2991  iron-sulfur cluster binding protein  33.63 
 
 
398 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  30.65 
 
 
374 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.63 
 
 
491 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002253  iron-sulfur cluster-binding protein  31.01 
 
 
375 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000253209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  26.9 
 
 
355 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
311 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.76 
 
 
362 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  31.03 
 
 
507 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  32.77 
 
 
314 aa  58.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  25.43 
 
 
354 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  23.85 
 
 
359 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  31.67 
 
 
366 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1030  iron-sulfur cluster binding protein  24.85 
 
 
373 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.43 
 
 
354 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2669  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.88 
 
 
450 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.848409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5422  domain of unknown function DUF1730  31.15 
 
 
389 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.98716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3194  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.06 
 
 
407 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.81 
 
 
357 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.43 
 
 
354 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  32.76 
 
 
404 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  25.44 
 
 
354 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  27.17 
 
 
380 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  31.09 
 
 
308 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  30.51 
 
 
352 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  31.03 
 
 
364 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3660  iron-sulfur cluster-binding protein  30.23 
 
 
411 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000246681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0705  iron-sulfur cluster-binding protein  30.23 
 
 
411 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2004  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.58 
 
 
450 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3805  iron-sulfur cluster binding protein  30.23 
 
 
379 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000182984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2541  putative iron-sulfur 4Fe-4S ferredoxin protein  34.88 
 
 
360 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.88 
 
 
445 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  31.97 
 
 
326 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0349  putative iron-sulfur cluster binding protein  27.37 
 
 
379 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000159146  unclonable  0.00000283659 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0434  iron-sulfur cluster-binding protein  32.85 
 
 
314 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3176  hypothetical protein  31.25 
 
 
380 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  25.73 
 
 
357 aa  55.1  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  26.61 
 
 
438 aa  55.1  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_002950  PG0472  iron-sulfur cluster binding protein, putative  23.16 
 
 
331 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0597  putative iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 
364 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0340  iron-sulfur cluster binding protein  30 
 
 
390 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35 
 
 
343 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2044  hypothetical protein  36.59 
 
 
330 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.281563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1527  putative iron-sulfur cluster-binding protein  26.8 
 
 
330 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000239897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.1 
 
 
380 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>