181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5170 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  30.68 
 
 		 228 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  31.08 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  31.08 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  30.71 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  32.39 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.65 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.41 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  28.74 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  28.24 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  27.16 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  29.03 
 
 		 219 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  27.94 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.88 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  28.23 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  30 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  22.03 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  23.72 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  25.2 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.07 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.37 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  29.68 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4554  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4149  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.08 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  23.26 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  23.9 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.6 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3901  virC1 gene, ATPase  25 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 		 195 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  25.96 
 
 		 195 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.91 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.16 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.35 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  24.63 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.98 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  23.29 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.75 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.41 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.75 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.75 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0001  hypothetical protein  20.32 
 
 		 353 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.50986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  28.23 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.98 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.75 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.75 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.98 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  28.22 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.84 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270203  hitchhiker  0.000435633 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  25.37 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.67 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  26.79 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  27.96 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  28.3 
 
 		 212 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 220 aa  48.9  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.33 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  29.34 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  29.91 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.98 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  28.11 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>