More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5113 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
325 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  34.56 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
326 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  32.93 
 
 
325 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.8 
 
 
325 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.36 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.42 
 
 
333 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.98 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
327 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
331 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.79 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
196 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09401  mitochondrial enoyl reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04150)  27.86 
 
 
422 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166107  normal  0.058667 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  30.62 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.74 
 
 
344 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34892  mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase 2  26.22 
 
 
366 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537322  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
322 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.28 
 
 
327 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.44 
 
 
324 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.57 
 
 
321 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  28.26 
 
 
368 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.23 
 
 
323 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5115  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
337 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.507573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  29.36 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  29.88 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.9 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.31 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.92 
 
 
326 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4143  alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00967604  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3671  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
325 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  28.79 
 
 
322 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.55 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.45 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.19 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.65 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.26 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.22 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.78 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.36 
 
 
327 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
321 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 
326 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.97 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.9 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.19 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  28.05 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  28.79 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  27.48 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2465  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  24.7 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.09 
 
 
320 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.41 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  28.13 
 
 
322 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.69 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  27.49 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.28 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.3 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.3 
 
 
330 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.1 
 
 
323 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2427  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
327 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2472  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
324 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.57 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.96 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.3 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.48 
 
 
331 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  28.31 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  29.48 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  27.02 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  29.48 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  30.28 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.56 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  29.48 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  29.48 
 
 
331 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.48 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  29.48 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.39 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.6 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84928  NADPH:quinone reductase  24.55 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.548816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>