229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4987 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4987  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  31.58 
 
 
304 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.74 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.71 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.09 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.86 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.69 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.07 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.3 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.43 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.61 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.69 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.4 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  29.69 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  29.69 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.69 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.07 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.43 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  28.03 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.47 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.45 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  27.66 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25.27 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  24.39 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  27.2 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  28.78 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.19 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  26.82 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  26.82 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  27.24 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  21.99 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.03 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  29.34 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.67 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.04 
 
 
341 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  27.97 
 
 
328 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.56 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.38 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.67 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.87 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  27.31 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  30.5 
 
 
356 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  30.5 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  30.5 
 
 
356 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 
287 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.88 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  23.78 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  25.09 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.45 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  27.36 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.37 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  29.44 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  25.08 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  21.31 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.05 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.81 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  28.25 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  26.26 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  28.57 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.77 
 
 
329 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  23.93 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  24.29 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.34 
 
 
294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.64 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.19 
 
 
299 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  21.36 
 
 
305 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.29 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.19 
 
 
299 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 
291 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.29 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.37 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.16 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.57 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.64 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  24.23 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.17 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.38 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  27.11 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  27.11 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.92 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>