50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1983 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1983  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5195  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2237  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4492  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  45.83 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  36.78 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2845  transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0599584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  46.27 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  35.63 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  35.63 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  35.63 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  35.63 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.09 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  35.63 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  44.59 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  31.76 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 248 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2535  transcriptional regulator, GntR family  43.24 
 
 		 219 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 268 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>