77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1824 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  100 
 
 
690 aa  1362    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  46.65 
 
 
522 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  47.26 
 
 
644 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  44.88 
 
 
542 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  47.81 
 
 
802 aa  237  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  35.42 
 
 
551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  39.8 
 
 
521 aa  198  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  39.48 
 
 
522 aa  197  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  38.01 
 
 
638 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  38.69 
 
 
521 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  39.16 
 
 
660 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  36.6 
 
 
514 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  41.7 
 
 
585 aa  194  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  46.12 
 
 
524 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  39.47 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  39.13 
 
 
522 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  34.57 
 
 
512 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  42.2 
 
 
781 aa  184  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  35.59 
 
 
599 aa  183  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  38.89 
 
 
522 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  35.88 
 
 
514 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  36.6 
 
 
401 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  48.1 
 
 
405 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  35.47 
 
 
569 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  34.05 
 
 
509 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  35.83 
 
 
724 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  35.78 
 
 
521 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  36.33 
 
 
521 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  35.69 
 
 
585 aa  170  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  34.89 
 
 
518 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  36.08 
 
 
1117 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  48.37 
 
 
405 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  41.98 
 
 
596 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  34.6 
 
 
821 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  40.31 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  44.33 
 
 
498 aa  145  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  38.83 
 
 
649 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  39.68 
 
 
522 aa  137  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  37.37 
 
 
517 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  40.1 
 
 
517 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  36.96 
 
 
394 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  36.27 
 
 
697 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  35.08 
 
 
478 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  30.54 
 
 
509 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  37.62 
 
 
686 aa  127  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  36.56 
 
 
470 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  38.95 
 
 
497 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  32.58 
 
 
402 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  30.2 
 
 
509 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  30.2 
 
 
509 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  35.6 
 
 
700 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  35 
 
 
479 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  34.72 
 
 
465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  31.67 
 
 
734 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.51 
 
 
740 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.35 
 
 
740 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  28.8 
 
 
499 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  28.8 
 
 
499 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  28.46 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  28.45 
 
 
389 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  27.78 
 
 
387 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  28.47 
 
 
386 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.49 
 
 
388 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  28.18 
 
 
388 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  26.61 
 
 
474 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  30.39 
 
 
405 aa  59.7  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  26.99 
 
 
388 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  25.97 
 
 
501 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  26.67 
 
 
398 aa  50.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  26.57 
 
 
475 aa  50.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  30.28 
 
 
400 aa  50.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.58 
 
 
392 aa  50.8  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.57 
 
 
475 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  25.41 
 
 
392 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  25.41 
 
 
392 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  22.57 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  26.63 
 
 
534 aa  44.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>