71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2921 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
125 aa  253  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  26.72 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  29.46 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  32.26 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  30.61 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  31.96 
 
 
648 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  31.25 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  29.63 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  30.97 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  25.47 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  29.91 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  29.57 
 
 
103 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  29.59 
 
 
154 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  29.59 
 
 
272 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  29.52 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  29.07 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  32.65 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  29.07 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  29.07 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  29.07 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  29.07 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  28.95 
 
 
669 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  31.68 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  27.91 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.8 
 
 
1265 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  29.51 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  25.23 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  32.65 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  25 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  25 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  25.21 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  26.74 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  27.47 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  26.85 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  29.91 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  27.35 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  25 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  24.14 
 
 
534 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  27.36 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  26.89 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  38.46 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  25.62 
 
 
189 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  35.8 
 
 
663 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
760 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  31.25 
 
 
760 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  69.57 
 
 
513 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  30.3 
 
 
164 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
124 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  26.17 
 
 
314 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  27.52 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  48.72 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  27.91 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  29.63 
 
 
856 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  27.68 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  28.74 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  27.68 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0468  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  27.72 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0289  cytochrome c oxidase, subunit II  43.55 
 
 
177 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166893  normal  0.771625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>