57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1956 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  79.28 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  77.48 
 
 
110 aa  170  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  73.87 
 
 
110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  73.87 
 
 
110 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  85.71 
 
 
110 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  85.71 
 
 
110 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  85.71 
 
 
110 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  85.71 
 
 
110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  85.71 
 
 
110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  84.52 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  80.22 
 
 
109 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  57.55 
 
 
116 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  57.01 
 
 
110 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  60 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  49.51 
 
 
119 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  54.95 
 
 
98 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  52.83 
 
 
132 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  57.14 
 
 
124 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  46.73 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  44.23 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  36.7 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  33.98 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  33.98 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  35.05 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  37.76 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  43.02 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  37.76 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  37.76 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  32.73 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  35.92 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  40.96 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  39.29 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  33.64 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  32.69 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  35.8 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  34.78 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  31.68 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  26.32 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  26.32 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  26.32 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  26.32 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  26.32 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1667  hypothetical protein  25.26 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  25.26 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  28.74 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1594  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.607033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>