63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2125 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  99.09 
 
 		 110 aa  219  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  99.09 
 
 		 110 aa  219  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  99.09 
 
 		 110 aa  219  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  95.45 
 
 		 110 aa  213  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  86.36 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  84.55 
 
 		 110 aa  189  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  94.55 
 
 		 110 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  91.11 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  91.95 
 
 		 109 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  75.68 
 
 		 111 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  62.11 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  57.55 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  58.16 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  56.38 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  60 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  45.87 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  52.81 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  52.87 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  48.31 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  37.96 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  35.56 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  39.53 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  30.91 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  36.89 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  36.89 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  33.94 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  28.97 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  35.14 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  33.01 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  36.73 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  37.63 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  37.63 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  37.63 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  37.63 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  37.63 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  37.63 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  30.48 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  29.07 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  28.77 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  30.84 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  24.71 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  24.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  24.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  24.71 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  24.71 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1594  hypothetical protein  25.3 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.607033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>