47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0382 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  98.39 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  59.05 
 
 
116 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  63.16 
 
 
126 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  54.05 
 
 
111 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  53.33 
 
 
119 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  52.83 
 
 
111 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  50.94 
 
 
122 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  45.87 
 
 
110 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  56.98 
 
 
116 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  52.81 
 
 
110 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  53.49 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  53.49 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  53.49 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  53.49 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  53.49 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  52.81 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  46.94 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  52.33 
 
 
109 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  44.04 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  36.63 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  37.36 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  28.28 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  29.63 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  34.09 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  29.63 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  28.45 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  28.45 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  28.45 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  37.93 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  29.63 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  31.63 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  31.63 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  31.63 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  36.47 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  29.63 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  29 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  32.93 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  36.62 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>