48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1305 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  227  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  42.61 
 
 		 115 aa  91.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  37.04 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  37 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  36.7 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  36.7 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  42.16 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  36.7 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  35.92 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  34.62 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  36.04 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  33.93 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  35.64 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  33.93 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  35.64 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  35.64 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  36.56 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  37.08 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  37.8 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  35.11 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  36.59 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  36.59 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  36.59 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  36.59 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  36.59 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  28.71 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  32.99 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  33.71 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  32.1 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  30.1 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  30.28 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  31.71 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  28.41 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1667  hypothetical protein  24.24 
 
 		 129 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>