58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3853 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  83.49 
 
 		 109 aa  191  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  55.14 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  48.62 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  45.37 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  47.71 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  47.66 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  41.12 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  37.74 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  41.35 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  38.89 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  40.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  42.05 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  35.19 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  40.7 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  32.99 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  37.96 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  37.76 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  34.04 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  40.51 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  35.96 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  35.37 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  36.9 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  26.61 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1594  hypothetical protein  25.86 
 
 		 129 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.607033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1667  hypothetical protein  26.8 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3751  hypothetical protein  24.14 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.563383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>