47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3504 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  54.05 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  61.8 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  60.23 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  56.82 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  48.04 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  53.57 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  44.14 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  45.92 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  44.23 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  49.44 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  49.44 
 
 		 110 aa  84.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  40.37 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  48.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  48.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  48.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  48.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  48.24 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  44.94 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  44.71 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  43.9 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  34.04 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  33.75 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  32.38 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  32.38 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  34.88 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  32.26 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  28.28 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  32.26 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  27.96 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  28.89 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  27.96 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  28.89 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  27.96 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  29.7 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  25.74 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  31.18 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  24.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>