47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3604 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  202  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  59.38 
 
 
122 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  58.33 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  59.18 
 
 
110 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  63.64 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  61.36 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  60.23 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  54.95 
 
 
111 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  45.92 
 
 
119 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  48.42 
 
 
110 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  46.74 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  46.94 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  46.32 
 
 
116 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  49.45 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  43.82 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  43.9 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  35 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  35.42 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  36.73 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  34.07 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  37.21 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  34.12 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  34.12 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  33.72 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  33.33 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  34.88 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  34.88 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  34.88 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  34.88 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  36.36 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  33.78 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  31.71 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>